联盟的科研人员则专注于修复战舰内部的能量系统和武器装备。他们深入到战舰的核心部位，仔细检查每一个线路、每一个能量节点。李一一带领着团队，对受损的武器系统进行升级改造，试图在现有技术基础上，研发出更具针对性的武器，以应对神秘敌人的黑暗能量武器。
在医疗舱内，来自不同星球的医疗人员们全力救治受伤的战士。潘多拉星球的医疗团队运用自然能量疗法，帮助重伤员恢复身体机能。绿色的自然能量光芒笼罩着伤员，他们身上的伤口以肉眼可见的速度愈合。赛博坦星球的医疗技术则侧重于机械修复，对于那些身体受到机械损伤的战士，汽车人们运用先进的机械义体技术，为他们更换受损的肢体，使其能够尽快重返战场。
在紧张的重整过程中，科研团队也没有停止对神秘敌人的研究。他们对战斗中收集到的敌人武器碎片、能量样本进行深入分析。李一一在实验室中，紧盯着显微镜下的黑暗能量样本，眼中闪过一丝惊讶：“这种黑暗能量在结构上又发生了变化，似乎敌人能够根据战斗情况迅速调整能量特性。”
与此同时，监测人员传来了令人不安的消息。在迷雾星系方向，再次检测到异常的能量波动，而且波动的强度和频率都在不断增加。“看来神秘敌人并没有放弃，他们很可能在酝酿着更强大的攻击。”岳飞看着检测报告，眉头紧锁。
刘启沉思片刻后说道：“我们要加快重整速度，同时加强对迷雾星系的情报收集。也许我们可以从他们之前的行动模式和能量特征入手，推测出他们下一步的攻击方向和手段。”
于是，联盟一方面加大了对侦察飞船的投入，派遣更多先进的隐形侦察飞船前往迷雾星系周边，利用各种先进的探测技术，试图穿透迷雾，获取更多关于神秘敌人的情报。另一方面，科研团队加快了新型武器和防御系统的研发进度，力求在敌人再次来袭时，能够有更充分的准备。
在这看似平静却暗流涌动的战后时光里，联盟深知，更大的危机或许即将来临。他们必须争分夺秒，在敌人发动下一轮攻击之前，提升自身实力，洞察敌人的阴谋，为守护宇宙和平做好万全准备。然而，神秘敌人究竟在谋划着什么？联盟能否及时破解敌人的计划，成功抵御即将到来的更大风暴？一切都还是个未知数，整个宇宙仿佛都被一层厚重的阴霾所笼罩，等待着联盟去冲破。